崩坏三的主线剧情开启,带我们回顾了以往的剧情发展，以及崩坏主书与外传中的相关设定，全新的剧情框架为玩家带来了一系列震撼人心的场景与转折。
主线剧情开始于芽衣正式成为律者,并在琪亚娜（K423）的感化下，压制住了律者的力量，御三家展开了一系列新任务，成功带回了月光王座，当他们带温蒂回学院时，却遭遇了意外：逆熵可可利亚的出现，打乱了这场平静的归途，可可利亚并非单纯的阻碍，而是有目的地"截击"了温蒂与芽衣，带走了这两位重要人物。
面对这一突发状况,德丽莎带队前去逆熵营地进行救援，在这一系列的战斗中，布洛妮娅为大家做出了无私的牺牲，她用自己的身体作为代价，成功烧毁了布洛妮娅的脑内生物芯片，换取了大家的生机，这场救援并没有带来完全的胜利，德丽莎为了治疗布洛妮娅，前往了地下数据库寻找相关资料，她的行动却引来了琪亚娜（K423）的尾随，在巴比伦实验室中，德丽莎与琪亚娜展开了激烈的对峙，最终在西林的帮助下，德丽莎成功击退了琪亚娜（K423）...
接下来的剧情发展呈现出一系列惊人的转折,丽塔的突然出现，再次为剧情增添了新的变数，在符华的帮助下，丽塔成功带走了琪亚娜（K423），这并没有平息危机，德丽莎与逆熵联手，展开了救援行动，最终在一场惊心动魄的对决中，成功将琪亚娜（K423）从奥托的控制之中解救出来，琪亚娜（K423）的身世之谜依然悬而未决。
在这一系列的战斗中,西林的觉醒成为了一道关键转折点，他意识到自己的局限性，决定寻求更强大的力量，贝纳勒斯的出现，为西林的觉醒提供了重要的支持，符华在关键时刻展现了非凡的能力，他成功阻止了奥托的暗算，保护了月轮战甲，在这一系列的对抗中，符华的命运再次与众多英雄的命运紧密相连。
随着剧情的推进,姬子的命运也经历了深刻的变化，她在地下见到了第四代女武神的装甲，展现出惊人的实力，在符华的帮助下，她成功穿戴了带有炎之律者核心的真红骑士月食，展现出强大的战斗力，在与琪亚娜（K423）的激烈对决中，她注入了专门设计的血清，成功压制住了崩坏之力，这一操作也让姬子付出了沉重的代价，她陷入了昏迷，坠入了虚数空间，目前生死未知。
在姬子失踪的同时,德丽莎与其他英雄继续追踪琪亚娜（K423）的下落，布洛妮娅则在爱因斯坦与特斯拉的帮助下，前往了量子之海，展开了一场惊心动魄的救援行动，在这一系列的冒险中，她们遇到了阿林姐妹，布洛妮娅在关键时刻展现了超凡的能力，成功带回了希儿，这场冒险并没有结束，布洛妮娅在量子之海中经历了一场深刻的觉醒，她融合了理之律者核心，成功掌控了理之律者权能。
第三方势力的阴影始终笼罩在剧情之上,世界蛇的登场成为了一场重大的转折点，这一势力的出现，不仅改变了量子之海的局势，也让整个崩坏世界面临了前所未有的挑战，他们的登场，不仅带来了新的敌人，更揭示了更大的未知。
这一系列的剧情发展,为崩坏三奠定了一个宏大的背景，无数英雄的命运纠缠在一起，他们的选择与斗争，将继续影响着这个充满神秘与危机的世界，玩家将在这一庞大的剧情框架中，书写属于自己的传奇。