导演的换动与主角的更换并非完全巧合。《谍影重重4》的导演是托尼·吉尔罗伊，与前三部的导演不同，这一变动暗示了影片在创作理念和叙事风格上有了调整，原主演马特·达蒙因片酬过高，成为了剧组负担不起的重担。《谍影重重》前三部在全球范围内取得了巨大的商业成功，这使得马特·达蒙的个人价值大幅提升，片酬谈判的结果也因此变得更加苛刻。
为了应对这一挑战,制作方决定重新选角，并寻找一个能够承担新角色且契合剧情发展的演员，杰瑞米·雷纳、爱德华·诺顿等美国演员最终接任了主演的位置，值得注意的是，尽管主角换成了杰瑞米·雷纳饰演的艾伦·克劳斯，但前三部的主角杰森·伯恩依然在影片中被多次提及，甚至暗示了他仍然存活，这一设计既为新主角的登场铺垫了背景，又为前三部的故事做了延续。
《谍影重重4》并非简单的重拍或前传，而是一部独立的故事，影片的英文片名为《伯恩的遗产》，揭示了其与前三部的联系虽然不大，但又暗含了某种延续，导演强调，这是一部全新的故事，主角艾伦·克劳斯将展开一个独立于前三部的冒险，影片并未完全打破与前三部的联系，艾伦·克劳斯的任务与"绊脚石计划"的阴谋，实际上是对前三部剧情的扩展。
关于谍影重重4和5的关联性,影片确实与前三部有着情节上的延续。《谍影重重4》的故事时间线与《谍影重重3》相同，但主角换成了艾伦·克劳斯，杰森·伯恩的名字和故事背景在影片中被多次提及，暗示了他仍然在国际阴谋中扮演重要角色，影片的剧情围绕艾伦·克劳斯展开，讲述了他与科学家玛泰博士合作，揭开"绊脚石计划"背后的真相的故事。
谍影重重4的剧情详解如下：继杰森·伯恩后，另一名美国中情局特工艾伦·克劳斯（由杰瑞米·雷纳饰演）也卷入了危险的阴谋中。"杰森·伯恩事件"的曝光，导致"绊脚石计划"的其他特工行动被公开，为了掩盖过去数十年来发展的特工行动，美国中情局正计划彻底铲除这些行动，包括"结果"计划中的"5号"特工艾伦·克劳斯的行动，在这一过程中，艾伦·克劳斯成为了逃亡中的特工，而他的唯一希望则是过去四年来一直监控他的科学研究员玛泰博士。
影片的结尾暗示了杰森·伯恩的身份已被彻底揭露，导致他的传奇故事走向终结，而艾伦·克劳斯则重复了杰森·伯恩的命运，不得不面对生死考验，导演强调，该片既不是重拍也不是续拍或前传，而是开启了一个全新的英雄篇章，尽管主角更换，但影片通过多次提及前三部的主角和事件，为观众提供了深厚的情感连接。